El proyecto busca aplicar el análisis avanzado a las opciones de tratamiento genómico para pacientes con tumor cerebral, con una versión personalizada de Watson, el computador de IBM que es “capaz de pensar”

El Centro del Genoma de Nueva York (NYGC) e IBM anunciaron una iniciativa para acelerar una nueva era de la medicina genómica con el uso del sistema cognitivo Watson de IBM. IBM y NYGC probarán un prototipo Watson único, diseñado específicamente para la investigación genómica como herramienta para ayudar a los oncólogos a dar atención más personalizada a los pacientes de cáncer.

NYGC y sus instituciones médicas asociadas planean evaluar inicialmente la habilidad de Watson de ayudar a los oncólogos a desarrollar una atención más personalizada a los pacientes con glioblastoma, un tumor cerebral agresivo y maligno que mata a más de 13.000 personas en EEUU por año. A pesar de descubrimientos revolucionarios sobre los determinantes genéticos de tipos de cáncer como el glioblastoma, pocos pacientes se benefician con un tratamiento personalizado a la medida de las mutaciones del cáncer específico que padecen. Los especialistas no cuentan con las herramientas ni el tiempo que se necesitan para acercar a sus pacientes opciones de tratamiento basadas en ADN y para hacerlo deben correlacionar datos de secuencias genómicas con pilas de publicaciones médicas, nuevos estudios e historias clínicas, en momentos en que la información médica se duplica cada cinco años.

Esta iniciativa conjunta entre NYGC y Watson busca acelerar este proceso complejo, identificando patrones en secuencias genómicas y datos médicos para revelar información que ayude a los médicos a acercar la promesa de la medicina genómica a sus pacientes. La combinación de los conocimientos genómicos y clínicos del NYGC y la potencia del sistema Watson de IBM permitirá desarrollar y refinar aún más la herramienta Watson, con el objetivo conjunto de ayudar a los profesionales médicos a desarrollar una atención personalizada del cáncer.

El nuevo sistema Watson basado en la nube estará diseñado para analizar datos genéticos junto con un gran volumen de literatura biomédica y bases de datos de drogas. Watson puede “aprender” continuamente a medida que encuentra nuevos escenarios de pacientes y surge nueva información de la investigación médica, los artículos de publicaciones científicas y estudios clínicos. En vista de la profundidad y velocidad de la capacidad de Watson de revisar bases de datos masivas, el objetivo de la colaboración es aumentar la cantidad de pacientes que tienen acceso a opciones de tratamiento a la medida del ADN de su enfermedad.

“Desde que se descifró por primera vez el genoma humano hace más de una década, hemos logrado grandes avances en entender los factores genéticos de la enfermedad. El verdadero desafío que enfrentamos es cómo dar sentido a las masivas cantidades de datos genéticos y cómo traducir esa información a mejores tratamientos para los pacientes,” comentó Robert Darnell, M.D., Ph.D., CEO, Presidente y Director Científico de New York Genome Center. “La aplicación de la potencia de cómputo cognitivo de Watson revolucionará la disciplina genómica y acelerará la oportunidad de mejorar los resultados para los pacientes de enfermedades graves, mediante una atención personalizada.”


Primera aplicación de Watson en investigación genómica

Watson complementará el rápido secuenciado genómico y se espera que reduzca sustancialmente el tiempo que lleva correlacionar las mutaciones genéticas de una persona con toneladas de literatura médica, hallazgos de estudios e indicaciones terapéuticas que pueden ser relevantes. La intención es proporcionar información integral para permitir a los especialistas considerar una variedad de opciones de tratamiento puedan ajustar a las mutaciones genéticas de sus pacientes. También ayudará a los científicos de NYGC a comprender los datos que detallan las variaciones en la secuencia genética entre biopsias normales y cancerosas de tumores cerebrales.

“A medida que la investigación genómica avanza y la información se vuelve más disponible, buscamos que el proceso de análisis sea mucho más práctico y accesible a través de innovaciones cognitivas y basadas en nube como Watson,” comentó John E. Kelly, PhD, Vicepresidente Senior y Director de IBM Research. “Con este conocimiento, los médicos podrán atacar el cáncer y otras enfermedades devastadoras con tratamientos diseñados a medida de los perfiles de ADN propios de los pacientes y la enfermedad. Si el proyecto tiene éxito, implicará una importante transformación que ayudará a mejorar las vidas de millones de pacientes en todo el mundo.”

El objetivo es hacer que el prototipo genómico Watson asista a los médicos a proporcionar información analítica genómica personalizada como parte de un estudio de investigación clínica de NYGC. La solución viene desarrollándose desde la última década en el Centro de Biología Computacional de IBM Research.


La inversión del Estado de Nueva York en medicina genómica

El estado de Nueva York se encuentra a la vanguardia del avance de las ciencias médicas y su comercialización. El Gobernador Cuomo recientemente propuso una partida de US$ 105 millones para financiar una alianza entre NYGC y la Universidad, en el Centro para Investigación Computacional de Buffalo, con el objetivo de promover la investigación genómica. Esta inversión para mejorar las capacidades de medicina genómica del estado, junto con la adquisición por parte de NYGC del avanzado sistema HiSeq X Ten de secuenciado completo del genoma humano de Illumina, acelerará la disponibilidad de valiosa información genómica en Nueva York.

IBM es Miembro Tecnológico Fundador del NYGC y promoverá los objetivos de la organización de traducir la investigación genómica en soluciones clínicas a enfermedades graves a través de la colaboración entre medicina, ciencia y tecnología. Conforme la biología se convierte en una ciencia de información, la promesa de la genómica se acerca a la realidad, con la ayuda de métodos analíticos basados en datos y con sistemas de cómputo más potentes. Los expertos en biología computacional de IBM y NYGC son reconocidos por acelerar los descubrimientos en el área de ciencias de vida utilizando profundos enfoques analíticos y tecnologías de información de próxima generación.